Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlgn1Q99K10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlgn1Q99K10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms