Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ophn1Q99J31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms