Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spdl1Q923A2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spdl1Q923A2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms