Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc44a4Q91VA1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a4Q91VA1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a4Q91VA1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms