Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk4Q8VEJ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dkk4Q8VEJ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk4Q8VEJ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms