Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt79Q8VED5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt79Q8VED5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms