Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep57l1Q8VDS7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep57l1Q8VDS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms