Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam20bQ8VCS3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam20bQ8VCS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam20bQ8VCS3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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