Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpap2Q8VC34 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap2Q8VC34 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpap2Q8VC34 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms