Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrit1Q8K099 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit1Q8K099 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit1Q8K099 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit1Q8K099 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit1Q8K099 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit1Q8K099 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit1Q8K099 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit1Q8K099 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms