Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
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Card11Q8CIS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Card11Q8CIS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Card11Q8CIS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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