Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arhgap29Q8CGF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arhgap29Q8CGF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms