Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ClasrpQ8CFC7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClasrpQ8CFC7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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