Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BC049762Q8C601 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC049762Q8C601 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms