Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Catsper4Q8BVN3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Catsper4Q8BVN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Catsper4Q8BVN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms