Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
6820408C15RikQ8BJX2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6820408C15RikQ8BJX2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms