Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp1Q8BJQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp1Q8BJQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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