Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll4Q80UG8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttll4Q80UG8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll4Q80UG8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms