Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SugctQ7TNE1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SugctQ7TNE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SugctQ7TNE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms