Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cnot1Q6ZQ08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms