Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NesQ6P5H2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NesQ6P5H2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NesQ6P5H2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms