Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac4Q6NZM9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac4Q6NZM9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac4Q6NZM9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms