Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Szrd1Q6NXN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Szrd1Q6NXN1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms