Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bfsp2Q6NVD9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bfsp2Q6NVD9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms