Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ggnbp1Q6K1E7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms