Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx11Q6AXC6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx11Q6AXC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms