Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg9aQ68FE2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms