Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp9cQ66X01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nlrp9cQ66X01 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nlrp9cQ66X01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms