Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup62Q63850 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nup62Q63850 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms