Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zic3Q62521 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms