Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufa4Q62425 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufa4Q62425 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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