Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd180Q62192 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd180Q62192 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd180Q62192 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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