Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhocQ62159 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhocQ62159 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhocQ62159 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhocQ62159 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms