Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Igbp1Q61249 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igbp1Q61249 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igbp1Q61249 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms