Protein–RNA interactions for Protein: Q61127

Nab2, NGFI-A-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab2Q61127 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nab2Q61127 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab2Q61127 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nab2Q61127 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms