Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mkrn3Q60764 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mkrn3Q60764 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mkrn3Q60764 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms