Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730522E02RikQ5SP45 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
5730522E02RikQ5SP45 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms