Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim7Q5RKS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim7Q5RKS2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms