Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm12185Q5NCB2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm12185Q5NCB2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms