Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkaa1Q5EG47 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkaa1Q5EG47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkaa1Q5EG47 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms