Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rtl5Q5DTT4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rtl5Q5DTT4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms