Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1td1Q587J6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1td1Q587J6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1td1Q587J6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms