Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb3Q571F5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spsb3Q571F5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms