Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otol1Q4ZJM7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otol1Q4ZJM7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms