Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228bQ497Q6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228bQ497Q6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms