Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms