Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BB287469Q3UT53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BB287469Q3UT53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BB287469Q3UT53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms