Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rmdn3Q3UJU9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rmdn3Q3UJU9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms