Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctu2Q3U308 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctu2Q3U308 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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