Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TchpQ3TVW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TchpQ3TVW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms